Zasadniczą część zbiorów stanowią autentyczne przedmioty pochodzące z obozu Kulmhof, odnalezione w trakcie wieloletnich prac archeologicznych, prowadzonych we wsi Chełmno (1997-2004) i Lesie Rzuchowskim (1986-1987; 2003-2004).
Zbiory dzielą się na:
- obiekty stałe (zachowane fundamenty pałacu, spichlerz, fundamenty krematorium, lapidarium oraz współczesne upamiętnienia i pomniki)
- tekstylia (fragmenty chałatów)
- przedmioty osobiste (okulary, klucze, maszynki do golenia, szczotki, szczoteczki do zębów, naczynia i sztuczce itp.)
- obuwie (zachowane fragmentarycznie skórzane obuwie)
- eksploatacje zwłok (zęby, protezy dentystyczne)
- przedmioty kultu religijnego (jady, świeczniki chanukowe, fragmenty macew)
- przedmioty artystyczne (pierścionki, bransoletki, naszyjniki, korale, papierośnice, wisiorki)